VetusLignum a écrit :Que signifie un ratio de 1% ? Une biomasse de 1 champignon pour 100 bactéries ?
Les ratios FFA de PLFA, ARN et protéines ont été calculés en utilisant les quantités de lipides, la proportion de séquences et l'abondance des protéines, respectivement. La proportion de champignons par rapport aux bactéries a été exprimée comme suit:
% p r o p o r t i o n F: B = Fu n gun l i n de xB a c t e r i a l i n de x× 100
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4977315/
et dans cette même étude de 2016 ou ils analysent un sol de prairie
Afin d'étudier le lien entre les structures communautaires microbiennes et le cycle du carbone du sol, nous avons choisi deux sols de l'expérience de biodiversité de Jena, une expérience de diversité de prairies à grande échelle établie en 2002 à Jena, en Allemagne ( Roscher et al., 2004 ). Les sols ont été choisis en fonction de la composition de la communauté microbienne dérivée de PLFA de 2007 ( Lange et al., 2014).), de sorte que les sols présentaient des propriétés physiques et chimiques similaires, mais différaient par la structure de leur communauté microbienne, et en particulier par leur rapport F: B. Par conséquent, les deux sols ont été nommés «sol bas F: B» et «sol haut F: B». Cette nomenclature a été suivie tout au long du présent rapport. Les deux sols avaient une texture de sol similaire (sable 44,6%, limon 39,6%, argile 15,8%) et pH 7,75. Les ratios C, N et C: N des sols étaient également très similaires à 2, 0,2 et 10,2%, respectivement ( Figure supplémentaire S1). Les deux sols différaient par le nombre d'espèces végétales (quatre dans le sol à faible teneur en F: B, huit dans le sol à forte teneur en F: B) mais pas par le nombre de groupes fonctionnels de la plante (une herbe, une petite herbe, une haute et légumineuse dans les deux sols). Le sol a été collecté à partir de noyaux en acier inoxydable en avril 2014 à une profondeur de 0 à 10 cm (à partir de trois parcelles répliquées spatialement pour chaque classe de sol), tamisé (<2 mm), toutes les racines visibles ont été enlevées, homogénéisées et stockées à 12 jours avant l’établissement des mésocosmes.
Je passe le détail du protocole de mesures
Avant de mettre en place l'expérience sur le mésocosme, la composition de la communauté microbienne à partir des biomarqueurs de PLFA a été réévaluée avec des sols provenant des mêmes parcelles de diversité. La teneur totale en PLFA bactérienne était de 18,46 ± 0,05 et de 23,55 ± 0,23 μg / g; tandis que la teneur en PLFA fongique a été mesurée à 0,52 ± 0,002 et 0,99 ± 0,01 μg / g dans des sols à faible teneur en F: B et à teneur élevée en F: B, respectivement.La proportion de champignons pour cent par rapport à des bactéries a été estimé à 2,8 ± 0,01 et 4,2 ± 0,07 à bas F: B et F élevé: sol B, respectivement ( Figure Figure1A 1A ). Le rapport F: B, dérivé de la PLFA, de la communauté microbienne du sol à teneur élevée en F: B était 1,5 fois supérieur à celui du sol à teneur faible en F: B (ANOVA à facteur unique; p <0,001).
On reste donc dans les 1 à 5 %
VetusLignum a écrit :Ce que j'ai cité fait consensus auprès de nombreux microbiologistes du sol.
Lesquels